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本所發展方向為明清史、近現代中國史、臺灣史、當代兩岸關係史、公眾史學。本所課程設計強調理論與實作並重，既注重史學研究基礎的訓練，也培養學生對在地社會的認識與關懷，發展公眾史學特色。本所畢業論文以研究論文為主，但朝向多元的公眾史學方向改革，例如：口述歷史、歷史小說、紀錄片、桌遊、田野調查等應用類別。本所教師積極參與研究社群，以中央為平台，推動各項歷史研究。近期重點計畫有：桃園學研討會、全球視野下的物質文化史研究群、科技部人社中心學術研習營、教育部精進師資素養計畫。本所常舉辦所內研討會、演講、論文發表會及讀書會，鼓勵學生多方參與活動，培養本職學能。本所與國內外各大學及研究機構簽有學術交流協議，協助師生積極交流訪問及蒐集資料。學校及歷史所設有各項獎學金，提供學生申請以便專注於研究。