本所歷任所長芳名錄：

第一任:賴澤涵教授 (1993年8月1日∼1996年7月31日)

第二任:張勝彥教授 (1996年8月1日∼1998年7月31日)

第三任:吳振漢教授 (1998年8月1日∼2001年7月31日)

第四任:齊茂吉教授 (2001年8月1日∼2004年7月31日)

第五任:吳振漢教授 (2004年8月1日∼2007年7月31日)

第六任:齊茂吉教授 (2007年8月1日∼2010年7月31日)

第七任:王成勉教授 (2010年8月1日∼2013年7月31日)

第八任:李力庸教授 (2013年8月1日∼2016年7月31日)

第九任:鄭政誠教授 (2016年8月1日~2019年7月31日)

第十任:蔣竹山教授 (2019年8月1日~2022年7月31日)

第十一任:皮國立教授 (2022年8月1日~2025年7月31日)

第十二任:皮國立教授 (2025年8月1日~現任)